Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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