Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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FarsaQ8C0C7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
FarsaQ8C0C7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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