Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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