Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms