Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms