Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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ChfrQ810L3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ChfrQ810L3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ChfrQ810L3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ChfrQ810L3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ChfrQ810L3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ChfrQ810L3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ChfrQ810L3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ChfrQ810L3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ChfrQ810L3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ChfrQ810L3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ChfrQ810L3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms