Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf7ipQ7TT18 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms