Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms