Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms