Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.1 ms