Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms