Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms