Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms