Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ecm2Q5FW85 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ecm2Q5FW85 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ecm2Q5FW85 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ecm2Q5FW85 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ecm2Q5FW85 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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