Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Urb1Q571H0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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