Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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