Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Rnf40Q3U319 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rnf40Q3U319 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rnf40Q3U319 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rnf40Q3U319 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rnf40Q3U319 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rnf40Q3U319 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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