Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms