Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ctdnep1Q3TP92 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Ctdnep1Q3TP92 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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