Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms