Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms