Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms