Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtnP63089 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtnP63089 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtnP63089 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtnP63089 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms