Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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