Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

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Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srp9P49962 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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