Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TfamP40630 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TfamP40630 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TfamP40630 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms