Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms