Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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