Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PparaP23204 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PparaP23204 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PparaP23204 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PparaP23204 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PparaP23204 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PparaP23204 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PparaP23204 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PparaP23204 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PparaP23204 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PparaP23204 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PparaP23204 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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