Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P20040 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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