Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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