Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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H2-Eb1P04230 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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H2-Eb1P04230 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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H2-Eb1P04230 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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H2-Eb1P04230 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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H2-Eb1P04230 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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H2-Eb1P04230 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Eb1P04230 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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H2-Eb1P04230 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms