Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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