Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DffaO54786 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DffaO54786 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DffaO54786 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DffaO54786 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DffaO54786 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DffaO54786 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DffaO54786 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DffaO54786 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DffaO54786 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DffaO54786 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
DffaO54786 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DffaO54786 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DffaO54786 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DffaO54786 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DffaO54786 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DffaO54786 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DffaO54786 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DffaO54786 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DffaO54786 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DffaO54786 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DffaO54786 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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