Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms