Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8356J3QPD3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms