Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tmem200cJ3QK46 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tmem200cJ3QK46 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tmem200cJ3QK46 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tmem200cJ3QK46 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tmem200cJ3QK46 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tmem200cJ3QK46 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tmem200cJ3QK46 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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