Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms