Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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