Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms