Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psma1Q9R1P4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms