Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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