Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdcQ9QW08 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdcQ9QW08 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms