Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms