Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms