Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms