Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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