Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCF9

Ssr3, Translocon-associated protein subunit gamma, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr3Q9DCF9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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