Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Hmgn3Q9DCB1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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