Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Spns3Q9D232 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Spns3Q9D232 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms